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多肽計算器

來源:康明永瑞  時間:2024-05-23 14:43:16  已閱:0

我們都知道多肽是由α-氨基酸以肽鍵連接在一起而形成的化合物,是蛋白質(zhì)水解的中間產(chǎn)物。通常由三字母或單字母表示,比如:

序列:GTFLVRCDMA為單字母形式,序列Gly-Thr-Phe-Leu-Val-Cys-Asp-Met-Ala為三字母形式,不管哪一種形式,所表達的多肽結(jié)構(gòu)都是唯一的。

其實這樣的寫法為了美觀或方便也隱藏了一些末端的信息,比如N端H、Ac,C端OH、NH2等(默認C端做成羧酸,有其他末端需要一定提前告知)

另外國際上統(tǒng)一規(guī)定:多肽的N端在最左邊,多肽的C端在最右邊,通常固相合成多肽是由C-N的方向合成。


多肽是為實驗而服務(wù)的,多肽本身的性質(zhì)能否滿足后續(xù)實驗的要求,我們能否在實驗之前的設(shè)計階段就對相應(yīng)的肽段有所了解也是很重要的。

今天給大家推薦2個專業(yè)的計算多肽性質(zhì)的網(wǎng)站,方便大家使用。

  1. Expasy - ProtParam tool

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這個多肽計算器可以清楚的了解到肽段的長短,分子量,等電點,疏水性,氨基酸百分比等數(shù)據(jù),是比較實用的一個工具,唯一的缺點是只能單字母輸入,

且不能添加修飾,末端等信息。


2.https://cem.com/en/peptide-calculator

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CEM的多肽計算器則更加豐富,可以給肽段添加不同的末端,在序列中添加非天然氨基酸,可以單字母或三字母輸入,計算合成多肽氨基酸的用量,合成難易程度等,更加適合多肽生產(chǎn)者的使用。

有了這兩個工具,可以幫助科研工作者們設(shè)計出更加符合實驗需要的肽段。

康明永瑞定制多肽合成業(yè)務(wù)包括:科研肽、藥物肽、偽脯氨酸二肽等??商峁┯啎摹⑷╇?、環(huán)肽、二硫鍵多肽、穿膜肽、各種抗菌肽、磷酸化肽、PEG肽、偶聯(lián)BSA和KLH抗原肽、各類榮光標記(FITC、FAM系列、Cy系列)、DOTA、NOTA等修飾的RDC肽、小分子化合物偶聯(lián)多肽等。

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